Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms