Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac7Q8C2B3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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