Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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