Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms