Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms