Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms