Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm12932-201ENSMUST00000143705 620 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm45510-201ENSMUST00000210059 638 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Olfr92-203ENSMUST00000216341 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms