Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nop58Q6DFW4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nop58Q6DFW4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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