Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q6DFW0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms