Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms