Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms