Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Tdrd5Q5VCS6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Tdrd5Q5VCS6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Tdrd5Q5VCS6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Tdrd5Q5VCS6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tdrd5Q5VCS6 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tdrd5Q5VCS6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tdrd5Q5VCS6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tdrd5Q5VCS6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tdrd5Q5VCS6 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tdrd5Q5VCS6 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms