Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms