Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Usp48Q3V0C5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp48Q3V0C5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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