Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Kdm5aQ3UXZ9 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Kdm5aQ3UXZ9 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Kdm5aQ3UXZ9 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Kdm5aQ3UXZ9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Kdm5aQ3UXZ9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Kdm5aQ3UXZ9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Kdm5aQ3UXZ9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Kdm5aQ3UXZ9 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Kdm5aQ3UXZ9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Kdm5aQ3UXZ9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Kdm5aQ3UXZ9 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm5aQ3UXZ9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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