Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm5460Q3UQ97 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm5460Q3UQ97 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm5460Q3UQ97 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm5460Q3UQ97 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5460Q3UQ97 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms