Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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