Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tpt1-ps5-201ENSMUST00000112150 516 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms