Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms