Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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