Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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