Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 304.7 ms