Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms