Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SctQ08535 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SctQ08535 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SctQ08535 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SctQ08535 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms