Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms