Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms