Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbdsP70122 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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