Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms