Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmod1P49813 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms