Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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