Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms