Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VtnP29788 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VtnP29788 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VtnP29788 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VtnP29788 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VtnP29788 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VtnP29788 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VtnP29788 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VtnP29788 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VtnP29788 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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