Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NapbP28663 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NapbP28663 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms