Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BgnP28653 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BgnP28653 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms