Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms