Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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PcnaP17918 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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