Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms