Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RhoP15409 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RhoP15409 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RhoP15409 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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