Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms