Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Bbip1J3QMK2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Bbip1J3QMK2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms