Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms