Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms