Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms