Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clrn2B2RVW2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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