Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt4B2RU40 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms