Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VarsQ9Z1Q9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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VarsQ9Z1Q9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VarsQ9Z1Q9 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VarsQ9Z1Q9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms