Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms