Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms