Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp29Q9ES63 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp29Q9ES63 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms