Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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